適應癥：①便血原因待查；②排便異常，如慢性腹瀉或長期進行性便秘；③Ｘ線鋇劑灌腸檢查結果陰性，但有明顯的腸道癥狀，尤其疑有惡變者，或Ｘ線鋇劑檢查異常，但不能定性者；④乙狀結腸鏡檢查未發現病變或病變性質未明者；⑤腹部包塊，尤其下腹部包塊需明確診斷者；⑥不明原因的消瘦、貧血；⑦結腸切除術后，需要檢查吻合口情況者；⑧需行結腸腔內手術、激光治療者，如結腸息肉切除術。
　　
　　禁忌癥：①肛門、直腸有嚴重的化膿性炎癥，或疼痛性病灶，如肛周膿腫、肛裂。②各種急性腸炎、嚴重的缺血性疾病及放射性結腸炎，如細菌性痢疾活動期、潰瘍性結腸炎急性期，尤其暴發型者；③婦女妊娠期，曾做過盆腔手術及患盆腔炎者，應嚴格掌握適應癥，慎重進行，婦女月經期一般不宜做檢查；④腹膜炎、腸穿孔、腹腔內廣泛粘連以及各種原因導致的腸腔狹窄者；⑤肝硬化腹水、腸系膜炎癥、腹部大動脈瘤、腸管高度異常屈曲及癌腫晚期伴有腹腔內廣泛轉移者；⑥體弱、高齡病例以及有嚴重的心腦血管疾病，對檢查不能耐受者，檢查時必須慎重。小兒及精神病患者不宜施行檢查，必要時可在全麻下施行。