肛瘺能轉變成癌癥。肛瘺合并肛門直腸癌的病例近年來不斷增多。

　　早在1936～1955年，Mark醫院曾發現肛瘺并有直腸膠樣癌8例；1966年Heidenreich綜合歐美文獻，肛瘺并有肛門直腸癌者131例，多數是粘液腺癌；1981年日本大腸癌研究會統計，日本全國已發現的肛瘺癌變，肛瘺持續5年以上者95例，10年以上者80例。

　　粘液腺癌占大多數，一般認為癌變與長期慢性炎癥的刺激有關。硬結形成，粘液分泌及疼痛常為癌變的先兆。10年以上者癌變率較高，值得人們引起高度的重視。由此，積極治療肛瘺，可以預防直腸癌的發生。