它的病原體是沙眼衣原體和脲原體（分解尿素支原體）。衣原體和支原體是不被大家認識的病原體。沙眼衣原體引起的疾病較多，如沙眼、性病性淋巴肉芽腫等，但沙眼衣原體可分為 18個血清型，不同的血清型可引起不同的疾病。支原體是比衣原體還要小的病原體，除引起生殖道的感染外，還可引起肺炎。在致病微生物中，細菌較衣原體大，衣原體較支原體大，而支原體又較病毒大。所以說衣原體和支原體是間乎于細菌和病毒之間的微生物。