逆行射精也有器質性的原因，可發生于某些手術后或長時間服用某些藥物以后，也有部分病例是由于全身或局部性疾病所致。常見的逆行射精器質性病因如下：

　　(1)手術：前列腺增生經尿道電切后，造成的膀航頸部括約肌撕裂、神經損傷，以致括約肌關閉不全。直腸癌或前列腺癌經會陰手術后，由于支配膀胱頸部神經不可避免地受到一定損傷，以致膀優頸部在射精時不能同步收縮。

　　(2)藥物：應用腎上腺素能阻滯劑，如利血平、胍乙啶、溴芐胺等。

　　(3)神經功能異常：雙側腰交感神經切除術后，導致支配膀跳頸部的神經功能異常。

　　(4)糖尿病：胰島素依賴型糖尿病引起的陰部神經損害，以致膀胱頸部功能失調，關閉機能減弱，射精時不能同步收縮。

　　(5)尿道狹窄：某些疾病損傷引起尿道極度狹窄，射精時精液前行受阻，以致逆流入膀胱。