核磁共振成像檢查可以從形態，功能、組織特征和代謝等方面對本病進行診斷。MRI顯示室間隔和(或)室壁肌局限性或普遍性肥厚、僵硬，室腔變形、縮小和(或)流出道狹窄。

　　MRI能提供更為詳細的肥厚型心肌病形態學異常資料，能檢測整體收縮正常的肥厚型心肌病患者區域性的左室不同步運動，對于分析由左室充盈指標產生的模糊結果更有價值。

　　肥厚型心肌病的MRI診斷標準：

　　①室間隔和(或)室壁肌局限性或普遍性肥厚，收縮末期厚度在15.0mm以上，與其同層面左心室后壁或正常心肌厚度的比值>1.5：1;

　　②肥厚的室間隔相室壁肌與正常心肌的核磁共振信號相同，呈均勻一致的中等信號強度;

　　③肥厚心肌塊向左心室腔內突出，致室腔縮小、變形和(或)流出道狹窄;

　　④肥厚心肌收縮期增厚率下降(T<30%)：

　　⑤需與造成室壁肥厚的其他心臟疾病，如高血壓、甲狀腺功能亢進和主動脈瓣狹窄等加以鑒別。