早期陰莖癌手術局部切除或包皮環切后病理證實，切緣不多，今后復發機會多。為減少復發，局部使用接觸放射治療或后裝近距離放射治療，也可用PYM軟膏或5-FU軟膏局部涂敷，有希望達到根治。

晚期陰莖癌手術、放療療效不理想，可先局部放療后再行手術根治，期望達到理想療效。
中期陰莖癌，既希望達到根治，又希望保留性功能，最好的方法是陰莖原發灶放射治療，而雙側腹股溝手術清掃，兩者密切配合，療效最理想。
晚期陰莖癌已不能手術，病人年輕，可先姑息性放射治療，放療后再用藥物治療，兩者緊密配合， 不但可減少病人痛苦，而且可延長生命，從而獲得一定療效。