有的人認為作了手術或停經后就不會再出現子宮內膜異位癥，事實上并非如此。如嚴重的子宮內膜異位癥還會在停經后繼續活躍，就是因為體內其他器官不斷地分泌荷爾蒙，因而使子宮內膜繼續生長和產生疼痛。其主要的原因是卵巢并不是身體內唯一生產雌激素的器官。在停經之后，腎上腺是荷爾蒙來源的另一地方，所以在停經后體內仍有足夠的雌激素去刺激子宮內膜的增生。更進一步使這些子宮內膜最后成了獨立的組織，不受任何內分泌的影響。如果病人的體重增加而超重的話，腎上腺用來制造雌激素的脂肪會更多，因此患這種疾病的機會就更大。由于子宮內膜可能在服用荷爾蒙后受到刺激而增生，有些醫生提出得子宮內膜異位癥的病人做子宮和卵巢切除手術之后，暫時不應該讓病人服用女性荷爾蒙。
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